棉花的种植区域过于集中，给棉纺织行业产生了一定的不良影响。由于棉花的产量与质量受天气因素影响较大，因此棉花种植过于集中，相当于把鸡蛋放在一个篮子里，如果某年气候条件不利，影响了棉花的产量和质量，那么会全国棉纺织行业都会受到极大影响。最典型的例子莫过于2010年前后，由于受极端天气影响，新疆产区棉花产量受到较大影响，全国棉纺织行业顿时一片哀嚎。
虽然我国现有三大棉花产区，然而仅有新疆产区的棉花种植形成一定规模，其他产区的种植分散，缺乏统一规划，受上年价格因素影响较大，种植面积很大程度上取决于棉农的意愿，不利于棉纺织行业的整体稳定。
在进口方面，我国棉花进口采用配额制度。根据WTO协定，我国每年配额进口89.4万吨棉花，实施1%的优惠关税;配额以外的进口棉花，征收5%—40%的滑准税。滑准税的征收，相当于为进口棉价设置了底限，其目的在于减少进口棉对国内棉花市场的冲击，确保棉农收益。然而，由于中国棉产量与纺织业需求之间有近300万吨的缺口，这就意味着无论棉价高低，都有逾200万吨棉花刚性需求通过缴纳高昂的滑准税进口。
配额制、滑准税在一定程度上妨碍了企业利用市场手段进行资源配置，造成了中国棉纺织行业成本偏高。目前澳洲棉花18000元/吨，印度棉花16000多元/吨，但是碍于配额制度，企业不能自主进口，而中国新棉要21400元才能买到同等质量的棉花。
前瞻产业研究院棉纺织行业研究小组分析认为，要解决棉花产量供不应求的现状，首先应该加大内部供给，从棉花种植入手，增加国内棉花产量。我国幅员辽阔，将鸡蛋放在多个篮子里，能够有效的降低风险。尤其是长江、黄河流域两大产区，需要尽快将棉花种植规模化、规范化，相关部门应该采取有效措施，保障棉花种植面积。其次，希望政府能够尽快了解目前市场现状，对进口配额制度和滑准税做相应的调整，早日给我国棉纺织行业去枷。
企业留人不易行业融资难亟待解决 新一代农民工正对劳动密集型制造业产生着巨大的影响，纺织业是其中的典型。调查显示，2011年纺织业工资平均涨幅在15%以上，但八成以上的企业依然存在用工短缺。根据企业反映，当前的这一代农民工多是独生子女，家庭结构和成长环境与过去大不相同。由于纺织工厂噪音大、气味重，再加上劳动强度较大、薪水又不算高，造成了企业招工难、留人难。
此外，西部经济的崛起在一定程度上加剧了东部发达地区制造业的“用工荒”。随着我国中西部地区经济增长，并承接了部分东部地区转移过去的产能，企业用工需求大幅增长，势必导致劳动力从东部沿海撤回到中西部，甚至出现了中部地区和东部地区“抢人”的情况出现。除了经济崛起外，中西部地区劳动力外流使得留守人员的社会治安问题，以及东部发达地区生活成本居高不下、生活压力加剧也促使这一形势不断加剧。
为了留住劳动力，部分企业选择福利留人。某公司总经理介绍，“去年，企业给每名职工都配发了电动车，月月还有各种小福利，春节期间还包车接送职工。预计今年企业薪酬还要上涨才能留住员工。留人不易，能留下来就是胜利。”
前瞻产业研究院棉纺织行业研究小组表示，随着人力成本的上升，以及用工荒等问题的凸显，已有部分企业将生产基地建设到中西部等招工难度相对较小的地区，甚至有部分企业选择到缅甸、柬埔寨、越南等劳动力相对丰富、劳力成本相对较低的国家建厂。这种方式也具有一定的参考意义，具体是否适合企业自身的情况，还需综合考虑供应商位置、交通物流条件等因素。
2011年以来，融资难成为了棉纺织行业头顶的另一座大山。在中国纺织工业联合会统计中心对行业500多家企业的调研中，有近四成企业融资利率比银行基准利率高10个百分点以上，山东等地的纺织业贷款利率普遍上浮30%以上，而且相当多的企业都被迫接受了承兑汇票业务。
贷款利率高，导致中小企业融资成本不断增加。还有部分银行通过变相收取管理费、咨询费、额度设立费、贷款承诺费、贷款安排费、风险保证金等，加大“桌子底下的成本”，以及要求将贷款额的部分用于购买银行指定的金融理财产品等，变相增加贷款成本，使中小企业的贷款成本较2010年增加三成以上。
融资难，对于银行业，甚至说对于国民经济，都无异于“火中取栗”、“竭泽而渔”，虽然利率高企可以给银行业带来眼前的利益，但从长远发展来看，却给自身埋下很大隐患。首先，高额的利息势必会逼死一批棉纺织企业，这批企业的倒下，导致其贷款无法追索，这是对银行业造成最直接的损失;其次，高额的利息，影响了部分企业的经营情况，进一步恶化后会对整个棉纺织行业形成不利影响，最终导致银行业的发展没有依托;再次，作为重要的国名经济支柱产业之一，棉纺织行业的不景气，会对整个国名经济造成恶劣影响。
前瞻产业研究院棉纺织行业研究小组分析认为，政府需要实时的关注棉纺织行业的难处，协调好银行与棉纺织行业企业之间的关系。银行需要将眼光放长远，不能以强势者自居，而是要放低身段，重新调整好与棉纺织行业的关系，解决好棉纺织行业融资难的问题，最终实现长远的双赢。
