目前短绒与棉子分离采用化学脱绒与机械脱绒两种方法。
化学脱绒是用硫酸、盐酸、氯化氢气体等腐蚀性化学试剂对棉子进行处理,将棉子上的短绒腐蚀掉,达到脱绒目的。经化学处理后,棉子上的短绒全被腐蚀,资源无法利用,而且消耗费用较高,但它的优点是棉子中的细菌、病毒、虫害等均可消除,为机械播种创造了有利条件。因此,专门作为种子用的棉子(良种棉子),适合采用化学脱绒的方法。
机械剥绒的优点是通过机械作用,使短绒与棉子分离后所获得的短绒得以充分利用,提高经济效益。另外,棉子上不同长度的短绒可以分别剥取下来,分成几种类型,以满足不同用途的需要。其缺点是棉子上的短绒难以全部剥光,如果短绒剥得过多,棉子容易受到损伤。